More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0276 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  100 
 
 		 261 aa  516  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  62.35 
 
 		 256 aa  311  4.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  54.33 
 
 		 275 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  53.73 
 
 		 285 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  53.73 
 
 		 275 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  52.92 
 
 		 277 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  52.92 
 
 		 277 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  53.33 
 
 		 277 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  53.33 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  50 
 
 		 280 aa  252  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  50.97 
 
 		 281 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  51.36 
 
 		 277 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  50.19 
 
 		 284 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  59.07 
 
 		 274 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  53.33 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  59.29 
 
 		 273 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  52.92 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  51.15 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  56.97 
 
 		 273 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  51.15 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  49.42 
 
 		 273 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  50.97 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  50.97 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  50.97 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  50.97 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  50.97 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  50.97 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  50.97 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  50.97 
 
 		 278 aa  246  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  47.08 
 
 		 263 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  50.19 
 
 		 274 aa  245  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  50.19 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  48.03 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  52.53 
 
 		 279 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  54.77 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  46.67 
 
 		 263 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  52.11 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  50.58 
 
 		 277 aa  237  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  45.1 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  48.05 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  47.84 
 
 		 262 aa  234  7e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  51.05 
 
 		 253 aa  231  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  49.8 
 
 		 282 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  50 
 
 		 258 aa  211  7e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  50 
 
 		 258 aa  211  7e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  46.5 
 
 		 262 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  48.48 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  49.13 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  40 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  34.5 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  35.18 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  35.04 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  35.04 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  34.63 
 
 		 268 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  36.72 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  33.72 
 
 		 261 aa  141  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  35.14 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  35.86 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  37.96 
 
 		 261 aa  138  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  36.19 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  36.99 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  31.89 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  34.84 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 270 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  31.45 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 		 278 aa  96.3  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 243 aa  95.9  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 251 aa  92.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.24 
 
 		 266 aa  92  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  27.31 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  26 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 		 251 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  30.41 
 
 		 622 aa  87  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 253 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 199 aa  86.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  30.43 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  28.79 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  27.64 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  27.83 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0882  ABC-2 type transporter  31.37 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  32.37 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0886  ABC-2 type transporter  31.37 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.301364  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5044  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4521  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2362  ABC transporter, inner membrane subunit  25.25 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0916375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1212  ABC-2 type transporter  27 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>