273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4127 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  46.8 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  41.09 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  36.96 
 
 		 268 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  41.67 
 
 		 255 aa  155  8e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  41.48 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  38.91 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  38.91 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  35.6 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  35.89 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  38.06 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  39.55 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  35.18 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  37.16 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  38.27 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  40.34 
 
 		 258 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  40.34 
 
 		 258 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  33.46 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  39.44 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  37.5 
 
 		 277 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  36.41 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  39.72 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  34.63 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.57 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  38.49 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  34.52 
 
 		 270 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  38.12 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  40.54 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  37.67 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  36.18 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  35.18 
 
 		 263 aa  129  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  35.71 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  39.35 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  38.99 
 
 		 253 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.94 
 
 		 281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  35.78 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  36.82 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  38.55 
 
 		 278 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  38.1 
 
 		 282 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  39.6 
 
 		 266 aa  125  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  34.04 
 
 		 262 aa  125  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  37.8 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  37.8 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  37.8 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  37.8 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  37.8 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  37.8 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  37.8 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  36.61 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  35.56 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  33.79 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  34.7 
 
 		 271 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.16 
 
 		 269 aa  122  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  35.97 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  38.25 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  35.41 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  38.25 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  38.25 
 
 		 277 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  33.63 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  37.86 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  37.96 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  37.9 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  38.71 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  36.32 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  39.35 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  39.09 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.87 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  36.6 
 
 		 262 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  37.96 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  36.59 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  36.59 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  36.05 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  37.97 
 
 		 622 aa  112  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  37.22 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  36.53 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  33.94 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  36.9 
 
 		 199 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  33.07 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  32.85 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.38 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1118  ABC-2 type transporter  32.99 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1192  ABC-2 type transporter  33.67 
 
 		 285 aa  75.1  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105603 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  27.64 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  26.84 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.24 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0755  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  24.9 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  26.18 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  26.18 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  26.94 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  26.38 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2287  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>