294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1801 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 253 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  44.18 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  40.78 
 
 		 278 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  39.18 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  35.92 
 
 		 278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  38.31 
 
 		 266 aa  155  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  38.17 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  36.16 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  37.5 
 
 		 622 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1118  ABC-2 type transporter  34.63 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  35.34 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 282 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  30.43 
 
 		 255 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1192  ABC-2 type transporter  33.67 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  35.92 
 
 		 265 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  33.64 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  32.3 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  31.86 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  31.89 
 
 		 268 aa  96.7  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  32.9 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 270 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  32.07 
 
 		 268 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  29.84 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 		 256 aa  85.9  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  26.58 
 
 		 263 aa  85.9  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  28.91 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.97 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  29.34 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.35 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  27.13 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.69 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.35 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  27.02 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  26.86 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  26.72 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  28.98 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.15 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  26.36 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  24.8 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  28.34 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  27.2 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.34 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  29.72 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  22.43 
 
 		 251 aa  72  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  27.24 
 
 		 280 aa  72  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.57 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  28.85 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  26.32 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  26.32 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  29.23 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  26.32 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  26.32 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  26.32 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  27.45 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  26.32 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  26.32 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  26.72 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  25.62 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.12 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  28.57 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  27.15 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  27.15 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  23.19 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  25.21 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  28.34 
 
 		 277 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  25.21 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  27.94 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  27.94 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  23.19 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  27.94 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  22.71 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0800  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0251444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  24.23 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0687  hypothetical protein  24.02 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  21.72 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  27.13 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  21.72 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  27.94 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  27.94 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  27.94 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  29.57 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  22.47 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  23.19 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  22.12 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>