295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0745 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  100 
 
 
278 aa  549  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  49.24 
 
 
294 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  40.78 
 
 
253 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  39.83 
 
 
278 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  44.13 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  43.72 
 
 
266 aa  171  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  40.43 
 
 
622 aa  165  8e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1118  ABC-2 type transporter  37.59 
 
 
294 aa  163  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  43.21 
 
 
256 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  39.11 
 
 
304 aa  159  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1192  ABC-2 type transporter  39.38 
 
 
285 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  38.27 
 
 
276 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  36.03 
 
 
265 aa  132  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  36.92 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 
262 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  35.32 
 
 
257 aa  125  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  33.99 
 
 
255 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  34.16 
 
 
270 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  35.12 
 
 
269 aa  119  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  32.28 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  34.25 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  33.79 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  35.86 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  31.65 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  33.58 
 
 
272 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  30.71 
 
 
263 aa  113  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 
255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  37.61 
 
 
268 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  31.62 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 
269 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  30.6 
 
 
262 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  33.33 
 
 
277 aa  105  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  33.94 
 
 
282 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 
260 aa  102  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  29.37 
 
 
262 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  32.68 
 
 
275 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  28.85 
 
 
263 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  30.92 
 
 
263 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.16 
 
 
262 aa  99  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  33.79 
 
 
254 aa  98.6  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.37 
 
 
275 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  32.03 
 
 
268 aa  96.7  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  34.98 
 
 
267 aa  96.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  29.41 
 
 
278 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  31.5 
 
 
279 aa  92.4  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.71 
 
 
282 aa  91.3  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  30.12 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  32.63 
 
 
199 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  32.13 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  28.63 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  28.63 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  28.63 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  28.63 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  28.63 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  28.63 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  28.63 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  31.46 
 
 
269 aa  89.4  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  28.44 
 
 
271 aa  89  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  32.61 
 
 
273 aa  89  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  32.14 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  32.14 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  29.92 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  29.92 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  32.58 
 
 
273 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.53 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  29.92 
 
 
277 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.06 
 
 
253 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  29.53 
 
 
277 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  32.08 
 
 
275 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  34.55 
 
 
274 aa  85.5  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  28.51 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  29.53 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  29.53 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.08 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.51 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  27.78 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  28.89 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  28.03 
 
 
284 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  27.68 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  28.24 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.09 
 
 
249 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  29 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  27.52 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.41 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.58 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  29.24 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.31 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  25 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  24.89 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  25.45 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>