More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1865 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  63.89 
 
 		 256 aa  330  1e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  57.87 
 
 		 263 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  57.53 
 
 		 260 aa  292  4e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  55.65 
 
 		 263 aa  266  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  48.63 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  42.8 
 
 		 255 aa  185  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  40.71 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  40.32 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  40.32 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  37.4 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  43.2 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  38.52 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  38.76 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  41.12 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  36.73 
 
 		 268 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  36.29 
 
 		 263 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  37.14 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  36.89 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  36.48 
 
 		 275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  39.35 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  34.84 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  35.47 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  34.43 
 
 		 278 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  34.43 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  34.43 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  34.43 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  34.43 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  34.43 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  34.43 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  34.43 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  33.61 
 
 		 262 aa  138  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  34.36 
 
 		 271 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  37.01 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  33.46 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  35.25 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  34.43 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  34.43 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  40.29 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  40.29 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  39.72 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  34.43 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  34.65 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  31.35 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  32.82 
 
 		 273 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  34.84 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  32.95 
 
 		 269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  34.84 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  32.95 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  40.28 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.53 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  34.88 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  37.96 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  40.28 
 
 		 273 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 270 aa  125  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  38.7 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.75 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  33.72 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  32.04 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  35.16 
 
 		 274 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  37.2 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  31.69 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  31.64 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.89 
 
 		 622 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.65 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  32.18 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 		 282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  32.38 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  31.42 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.62 
 
 		 262 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  32.33 
 
 		 272 aa  99  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 278 aa  86.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  30.4 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  30.97 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  25.32 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.23 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  30.1 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  25.32 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  28.94 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  25.32 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0616  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.33089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  26.34 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4180  hypothetical protein  26.81 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  26.92 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  25.11 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  24.23 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1506  ABC-2 type transporter  25.32 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  28.23 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  26.96 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>