More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1805 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  100 
 
 		 273 aa  540  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  97.8 
 
 		 273 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  90.35 
 
 		 274 aa  434  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  77.1 
 
 		 285 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  80.16 
 
 		 289 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  72.18 
 
 		 275 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  70.3 
 
 		 275 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  67.27 
 
 		 275 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  66.42 
 
 		 278 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  68.3 
 
 		 277 aa  334  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  68.3 
 
 		 277 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  69.29 
 
 		 277 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  66.91 
 
 		 277 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  66.91 
 
 		 277 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  66.92 
 
 		 279 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  68.11 
 
 		 278 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  68.11 
 
 		 278 aa  329  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  68.11 
 
 		 278 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  68.11 
 
 		 278 aa  329  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  68.11 
 
 		 278 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  66.79 
 
 		 277 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  68.11 
 
 		 278 aa  329  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  68.11 
 
 		 278 aa  329  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  58.1 
 
 		 262 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  57.87 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  54.72 
 
 		 263 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  55.91 
 
 		 262 aa  291  8e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  57.65 
 
 		 256 aa  281  7.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  56.15 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  57.37 
 
 		 261 aa  254  9e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  50 
 
 		 273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  55.17 
 
 		 262 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  52.46 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  51.54 
 
 		 280 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  50 
 
 		 277 aa  246  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  51.41 
 
 		 281 aa  244  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  48.18 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  58.4 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  48.51 
 
 		 271 aa  234  9e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  47.55 
 
 		 269 aa  232  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  47.55 
 
 		 269 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  48.75 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  53.42 
 
 		 253 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  50.19 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  46.99 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  50.87 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  50.87 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  48.35 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  42.06 
 
 		 255 aa  182  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  36.18 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  35.04 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  36.07 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  35.04 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  36.89 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  37.35 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  35.18 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  36.44 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  38.68 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  34.3 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  37.2 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  39.83 
 
 		 261 aa  138  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  33.73 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  36.33 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  31.75 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  32.24 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  33.65 
 
 		 269 aa  112  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  32.78 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  33.64 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  32.03 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  34.68 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  32.44 
 
 		 622 aa  99.4  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  31.02 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  28.17 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  35.14 
 
 		 266 aa  95.5  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  29.25 
 
 		 265 aa  92.8  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  33.59 
 
 		 294 aa  92  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  31.25 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 		 199 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.86 
 
 		 249 aa  86.3  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  30.17 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  30.26 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  31.09 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.14 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  26.15 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  24.1 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  29.65 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.42 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0495  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.2 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  29.25 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.23 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0559  ABC transporter permease protein  27.19 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>