159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12470 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 199 aa  395  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  50.79 
 
 		 266 aa  204  9e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  51.32 
 
 		 282 aa  201  6e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  51.32 
 
 		 622 aa  199  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  55.29 
 
 		 282 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  51.85 
 
 		 276 aa  197  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  51.4 
 
 		 268 aa  165  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  43.32 
 
 		 269 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  46.24 
 
 		 272 aa  159  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  39.66 
 
 		 265 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  45.5 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  43.92 
 
 		 269 aa  139  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  39.62 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  35.05 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 263 aa  106  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  34.81 
 
 		 255 aa  99.8  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  34.81 
 
 		 255 aa  99.8  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  38.18 
 
 		 304 aa  99.4  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  34.3 
 
 		 262 aa  98.2  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  36.9 
 
 		 261 aa  97.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  33.72 
 
 		 255 aa  96.7  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 278 aa  94.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  31.52 
 
 		 258 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.52 
 
 		 258 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  34.88 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  32.69 
 
 		 256 aa  93.2  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  32.28 
 
 		 260 aa  93.6  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  32.45 
 
 		 267 aa  92.8  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  34.32 
 
 		 270 aa  91.3  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  32.72 
 
 		 274 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  33.33 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  32.75 
 
 		 262 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.06 
 
 		 282 aa  89.4  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  32.63 
 
 		 278 aa  88.2  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1118  ABC-2 type transporter  35.16 
 
 		 294 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  29.79 
 
 		 261 aa  86.3  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  32.68 
 
 		 273 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  32.68 
 
 		 273 aa  85.1  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  32.46 
 
 		 294 aa  85.1  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  33.11 
 
 		 275 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  30.3 
 
 		 262 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  30.41 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  31.28 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  31.28 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  31.28 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  31.28 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  31.28 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  31.28 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  31.28 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  30.97 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1192  ABC-2 type transporter  35.05 
 
 		 285 aa  81.3  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  32.03 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  31.76 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  31.41 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  32.43 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  31.49 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  30.64 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  30.73 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  33.14 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  31.37 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  29.25 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  31.13 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  31.21 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  31.21 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  31.21 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  30.1 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  30.64 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  27.89 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.33 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  27.89 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  28.57 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  30.64 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  32 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  30.61 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  30.93 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  31.21 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  30.81 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  28.74 
 
 		 274 aa  72  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  28.22 
 
 		 263 aa  72  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  27.89 
 
 		 281 aa  71.6  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.77 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  29.23 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  28.74 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.13 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  29.07 
 
 		 251 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  25.95 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  25.83 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  25.83 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 273 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  23.73 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  26.16 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  25.54 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  28.24 
 
 		 246 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2524  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 253 aa  49.3  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.94 
 
 		 254 aa  48.9  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 251 aa  48.5  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  29.73 
 
 		 623 aa  48.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>