265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25210 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 304 aa  597  1e-170  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1118  ABC-2 type transporter  48.2 
 
 		 294 aa  276  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1192  ABC-2 type transporter  49.42 
 
 		 285 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105603 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  47.74 
 
 		 622 aa  232  8.000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  38.2 
 
 		 278 aa  159  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  35.29 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  38.13 
 
 		 278 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  40.16 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  36.29 
 
 		 256 aa  139  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  39.82 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  35.89 
 
 		 266 aa  132  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  35.42 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  30.4 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  34.8 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  32.64 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  37.95 
 
 		 199 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  33.57 
 
 		 272 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  34.6 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  30.45 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  34.15 
 
 		 265 aa  95.9  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  36.41 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  30.31 
 
 		 258 aa  93.2  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 256 aa  92.4  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  34.18 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  31.17 
 
 		 255 aa  89.7  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 		 268 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  27.43 
 
 		 263 aa  87.4  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  31.17 
 
 		 255 aa  86.3  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  30.74 
 
 		 255 aa  85.5  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.3 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  30.43 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  32.38 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  30.43 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.55 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  31.55 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  30.87 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  30.87 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  30.87 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  30.87 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  30.87 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  31.62 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  30.87 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  30.87 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  30.69 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  28.68 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  27.68 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  28 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.17 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  26.44 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  26.04 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0559  ABC transporter permease protein  25 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  24.44 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0495  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  25.29 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  23.24 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.64 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  26.2 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  28.71 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  25.83 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  27.53 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  27.8 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  27.73 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  27.8 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  22.41 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  28.64 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  29.13 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  23.56 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  22.87 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  22.87 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  26.97 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  27.78 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  28.64 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  28.64 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  28.64 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.18 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  27.8 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  30.1 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.82 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  23.71 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  24.9 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  24.47 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  23.01 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  27.61 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  21.46 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  22.41 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0755  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2018  hypothetical protein  25.11 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.803499  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  22.93 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>