186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3422 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 271 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  90.6 
 
 		 266 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  48.12 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  47.58 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  44.13 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  39.68 
 
 		 253 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  38.91 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  38.58 
 
 		 622 aa  144  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1118  ABC-2 type transporter  35.68 
 
 		 294 aa  138  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  39.26 
 
 		 276 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  39.39 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1192  ABC-2 type transporter  35.47 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  33.87 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  35.32 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  36.4 
 
 		 266 aa  116  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  37.33 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  37.33 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  36.45 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  36.45 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  36.45 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  36.45 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  36.45 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  36.45 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  36.45 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  31.67 
 
 		 255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  32.64 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  36.45 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  36.95 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  32.73 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  37.44 
 
 		 275 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  37.44 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  33.03 
 
 		 282 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  36.95 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  36.95 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 269 aa  106  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  36.45 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  35.98 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  36.45 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  35.96 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  33.64 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.06 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  35.96 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  30.04 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  29.28 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  29.28 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.47 
 
 		 282 aa  99  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 		 256 aa  98.6  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  33.99 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  29.96 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.55 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  34.8 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  30.65 
 
 		 268 aa  96.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  32.66 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  36.17 
 
 		 272 aa  93.2  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.88 
 
 		 273 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  29.55 
 
 		 256 aa  92.8  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  27.8 
 
 		 263 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.88 
 
 		 273 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  28.11 
 
 		 262 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  33.62 
 
 		 269 aa  92.8  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  29.91 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 260 aa  91.3  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  33.51 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  33.73 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  32.63 
 
 		 199 aa  86.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  30.73 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.22 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.82 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  27.31 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  26.34 
 
 		 269 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  26.34 
 
 		 269 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  26.97 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  32.33 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  30.36 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  26.02 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  25.81 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  26.73 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.48 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  24.48 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  24.48 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0881  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0495  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  29.13 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0559  ABC transporter permease protein  26.17 
 
 		 259 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0755  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 		 254 aa  53.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2042  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 273 aa  52.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0166481 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 		 373 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>