More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0632 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  100 
 
 		 274 aa  544  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  87.79 
 
 		 284 aa  450  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  75.55 
 
 		 273 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  74.35 
 
 		 269 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  74.9 
 
 		 281 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  74.35 
 
 		 269 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  73.9 
 
 		 271 aa  391  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  70.29 
 
 		 280 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  54.44 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  51.18 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  50.59 
 
 		 277 aa  238  6.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  48.68 
 
 		 275 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  48.3 
 
 		 275 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  50.19 
 
 		 261 aa  232  6e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  49.03 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  51.85 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  46.82 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  48.03 
 
 		 278 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  48.03 
 
 		 278 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  48.03 
 
 		 278 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  48.03 
 
 		 278 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  48.03 
 
 		 278 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  48.03 
 
 		 278 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  48.03 
 
 		 278 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  51.69 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  48.43 
 
 		 277 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  48.83 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  47.23 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  48.82 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  48.82 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  48.82 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  48.82 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  46.85 
 
 		 275 aa  214  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  47.25 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  50.42 
 
 		 274 aa  212  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  51.32 
 
 		 273 aa  205  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  50.21 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  41.18 
 
 		 262 aa  201  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  42.4 
 
 		 263 aa  201  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  42.35 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  47.26 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  39.37 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  42.29 
 
 		 262 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  43.57 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  43.57 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  41.96 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  44.44 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  39.92 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  38.84 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  38.43 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  40.82 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  38.84 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  37.65 
 
 		 268 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  34.5 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  35.96 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  35.16 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  34.8 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  32.49 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  31.6 
 
 		 272 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  36.32 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  38.71 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 270 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  31.27 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  32.42 
 
 		 260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 269 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 		 251 aa  92.4  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 251 aa  89.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  31 
 
 		 265 aa  88.6  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.61 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.05 
 
 		 622 aa  87.4  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 269 aa  86.3  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  30.22 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  25.53 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  29.53 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  29.47 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  32.37 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1212  ABC-2 type transporter  31.1 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.58 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  29.71 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.54 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0280  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>