More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2056 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 251 aa  497  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  63.35 
 
 		 251 aa  328  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  59.76 
 
 		 251 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  60.16 
 
 		 251 aa  311  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  63.18 
 
 		 239 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  62.55 
 
 		 251 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  28.29 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  27.89 
 
 		 255 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  28.86 
 
 		 243 aa  85.5  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  31.47 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  32.44 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  27.89 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.4 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  29.32 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  26 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  29.36 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  27.6 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  27.46 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  29.57 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  26.21 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  29.29 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  31.07 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  27.31 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2743  hypothetical protein  26.58 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  30.1 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  31.91 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  30.35 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  29.03 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  29.03 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  30.51 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  28.9 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  27.35 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  27.35 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  27.35 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  27.35 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  27.35 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  27.35 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  28.23 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  27.42 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  27.5 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  27.5 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  27.5 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  27.5 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  27.5 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  27.5 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  27.5 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  26.45 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  27.82 
 
 		 278 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  27.82 
 
 		 278 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  27.82 
 
 		 278 aa  72  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  27.82 
 
 		 278 aa  72  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  27.82 
 
 		 278 aa  72  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  27.82 
 
 		 278 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  27.82 
 
 		 278 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  27.42 
 
 		 279 aa  72  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  30.16 
 
 		 281 aa  72  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  29.79 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.24 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  26.02 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.61 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2997  ABC transporter, permease protein  27.08 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2479  hypothetical protein  28.23 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0755  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.79 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  25.62 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  25.91 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  28.18 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  25.62 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  24.49 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  27.36 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.89 
 
 		 622 aa  70.1  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  25.11 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  30.49 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  31.07 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  30.68 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>