More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3305 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  100 
 
 		 258 aa  510  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  54.25 
 
 		 258 aa  249  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  54.25 
 
 		 258 aa  249  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  51.33 
 
 		 267 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  50.4 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  48.59 
 
 		 275 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  45.06 
 
 		 262 aa  234  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  48.19 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  49.8 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  48 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  47.77 
 
 		 275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  47.79 
 
 		 279 aa  228  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  48.19 
 
 		 277 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  48.19 
 
 		 277 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  48.19 
 
 		 277 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  46.59 
 
 		 277 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  46.99 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  46.99 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  43.08 
 
 		 263 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  44.53 
 
 		 263 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  44.58 
 
 		 278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  44.58 
 
 		 278 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  44.58 
 
 		 278 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  44.58 
 
 		 278 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  44.76 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  44.58 
 
 		 278 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  44.58 
 
 		 278 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  44.58 
 
 		 278 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  44.58 
 
 		 278 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  50.64 
 
 		 274 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  49.79 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  47.86 
 
 		 289 aa  211  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  49.12 
 
 		 273 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  48.05 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  40.08 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  47.26 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  48.18 
 
 		 273 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  46.91 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  47.92 
 
 		 262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  45.31 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  40.24 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  39.06 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  38.25 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  38.87 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  37.45 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  37.9 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  37.4 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  37.4 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  37.85 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  37.85 
 
 		 269 aa  171  9e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  39.92 
 
 		 274 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  39.52 
 
 		 284 aa  166  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  40.56 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  37.93 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  35.04 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  38.84 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  36.44 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  36.03 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  36.03 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  37.15 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  38.06 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  35.83 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  35.56 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  34.71 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  32.64 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  37.13 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.11 
 
 		 622 aa  112  7.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  35.27 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  31.62 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  31.39 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  32.64 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  33.63 
 
 		 268 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  29.88 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 		 282 aa  99.4  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  32.35 
 
 		 266 aa  99  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 251 aa  98.6  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 269 aa  96.3  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0558  ABC-2 type transporter  36.21 
 
 		 244 aa  93.2  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 269 aa  89  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  30.13 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  24.1 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  31.56 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.17 
 
 		 304 aa  85.1  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1212  ABC-2 type transporter  31.07 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  31.41 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  32 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1118  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  26.29 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1192  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03055  ABC-2 type transporter  26.2 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.39 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  26.25 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>