More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0552 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 244 aa  488  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  46.9 
 
 		 243 aa  218  7e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0558  ABC-2 type transporter  46.72 
 
 		 244 aa  210  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  41.74 
 
 		 243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  37.23 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  39.22 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  40.65 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  37.61 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0687  hypothetical protein  34.98 
 
 		 275 aa  135  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1212  ABC-2 type transporter  34.3 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  32.59 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  28.15 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  28.94 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 		 262 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  29.95 
 
 		 259 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  29.95 
 
 		 259 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  29.36 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 		 259 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  31.58 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  32.07 
 
 		 271 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  33.33 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1506  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4180  hypothetical protein  30.46 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  30.23 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  28.09 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  31.19 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  32.41 
 
 		 260 aa  92.8  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 		 273 aa  92.4  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  28.04 
 
 		 256 aa  91.7  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15510  ABC-2 type transporter, permease component  32.32 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 		 256 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  31.02 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.05 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  31.05 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  31.05 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  30.96 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  29.47 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  30.96 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  30.96 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  31.05 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  30.96 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.47 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  31.05 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  31.05 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  31.05 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  29.05 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1920  ABC-2 type transporter  29.95 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00135758  normal  0.376856 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  28.29 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  30.25 
 
 		 256 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  30.25 
 
 		 256 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  30.25 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  30.48 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  30.48 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  27.7 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  30.48 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  31.51 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  31.51 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  31.51 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  31.51 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  31.51 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  31.22 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0881  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 276 aa  89  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  34.76 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  30 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  31.31 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  28.5 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  28.5 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  30.89 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  31.14 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  28.19 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  29.95 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1637  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 188 aa  86.3  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  30.27 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  30.52 
 
 		 257 aa  85.5  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  27.91 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  27.91 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  27.91 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  27.91 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  27.91 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  27.91 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  27.91 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  29.71 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>