198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1193 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  100 
 
 
282 aa  556  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  83.87 
 
 
282 aa  474  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  62.64 
 
 
266 aa  341  5.999999999999999e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  63.98 
 
 
622 aa  339  2.9999999999999998e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  48.12 
 
 
276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  42.47 
 
 
269 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  40.94 
 
 
269 aa  201  9e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  51.32 
 
 
199 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  44.9 
 
 
268 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  41.73 
 
 
269 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  42.25 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  38.96 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  34.22 
 
 
256 aa  132  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  37.88 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  36.63 
 
 
263 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  34.94 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  32.78 
 
 
255 aa  115  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  34.38 
 
 
262 aa  112  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  29.78 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 
261 aa  109  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.55 
 
 
304 aa  109  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1118  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 
294 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  33.33 
 
 
255 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  33.33 
 
 
255 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.09 
 
 
262 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  32.77 
 
 
273 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  27.13 
 
 
263 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  33.62 
 
 
253 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 
278 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  33.03 
 
 
278 aa  102  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  31.14 
 
 
271 aa  102  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  31.98 
 
 
294 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  32.87 
 
 
268 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  28.46 
 
 
267 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.29 
 
 
263 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.04 
 
 
273 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  26.36 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  31.23 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  29.88 
 
 
258 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  29.23 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  26.21 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  28.09 
 
 
275 aa  95.9  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  29.11 
 
 
268 aa  95.9  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  28.89 
 
 
256 aa  95.5  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  29.06 
 
 
277 aa  95.9  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.75 
 
 
262 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  29.64 
 
 
278 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  28.69 
 
 
254 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 
270 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  30.8 
 
 
278 aa  92.4  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  30.8 
 
 
278 aa  92.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  30.8 
 
 
278 aa  92.4  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  30.8 
 
 
278 aa  92.4  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  30.8 
 
 
278 aa  92.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  30.8 
 
 
278 aa  92.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  30.8 
 
 
278 aa  92.4  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1192  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105603 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  31.71 
 
 
256 aa  92.4  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  27.41 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  30.21 
 
 
258 aa  89.7  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  31.05 
 
 
289 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  27.61 
 
 
275 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  30.21 
 
 
258 aa  89.7  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  27.31 
 
 
281 aa  89  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  28.36 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  28.42 
 
 
279 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.44 
 
 
253 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  29.6 
 
 
263 aa  85.9  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  27.36 
 
 
271 aa  85.5  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  25.19 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  28.04 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  28.04 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  28.04 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  25.68 
 
 
269 aa  82  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  25.68 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  25.19 
 
 
280 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  28.57 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  28.57 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  25.7 
 
 
274 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.02 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.15 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  24.54 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  25.98 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0687  hypothetical protein  25.64 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113774  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  22.97 
 
 
251 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  22.78 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 
251 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 
243 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  27.08 
 
 
250 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  28.78 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  22.9 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  21.4 
 
 
251 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  22.17 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.53 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 
273 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  28.7 
 
 
284 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 
251 aa  55.5  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>