More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2221 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 241 aa  476  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  69.17 
 
 		 259 aa  342  2e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2485  hypothetical protein  68.33 
 
 		 255 aa  318  5e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1227  ABC-2 type transporter  36.82 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  35.87 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0022  ABC-2 type transporter  36.55 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  35.71 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2468  ABC-2 type transporter  38.76 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2256  ABC-2 type transporter  37.07 
 
 		 247 aa  148  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.038902 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  32.74 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  32.42 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  25.46 
 
 		 290 aa  78.6  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 251 aa  72  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.87 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.8 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.19 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.21 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  26.87 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.62 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.71 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.22 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.12 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  20.16 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  21.83 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  26.29 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  24.71 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 		 443 aa  58.9  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 		 371 aa  58.5  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  29.67 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.96 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.32 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  26.91 
 
 		 360 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  22.52 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  22.9 
 
 		 360 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  25.24 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0967  ABC-2 type transporter  22.69 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  23.71 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  31.22 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  28.67 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  28.75 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  27.31 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 339 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  30.69 
 
 		 339 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  30.69 
 
 		 339 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  32.45 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  22.71 
 
 		 371 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 		 377 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 		 339 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2004  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 372 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  30.91 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  28.31 
 
 		 261 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  27.6 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  30.91 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.21 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  30.16 
 
 		 339 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  29.88 
 
 		 371 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  30.16 
 
 		 339 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  22.45 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  27.08 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  27.4 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  25.16 
 
 		 372 aa  52.4  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.44 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  24.27 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  21.58 
 
 		 256 aa  52  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  26.48 
 
 		 277 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  29.19 
 
 		 376 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  25.1 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  22.71 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 368 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2803  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  24.23 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  25.65 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  26.7 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1224  ABC-2 type transporter  29.51 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.227587  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  24.61 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  24.74 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  22.62 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>