More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0022 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0022  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 251 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  57.77 
 
 		 251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1227  ABC-2 type transporter  50.2 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2468  ABC-2 type transporter  43.21 
 
 		 248 aa  201  8e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  41.25 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  36.55 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2256  ABC-2 type transporter  38.19 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.038902 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2485  hypothetical protein  38.56 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  35.15 
 
 		 259 aa  166  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.9 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.36 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.86 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.86 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  29.08 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.46 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.05 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  25.76 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  25.76 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  26.26 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.04 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.05 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  25.25 
 
 		 263 aa  62  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.64 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  30.96 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  24.79 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.64 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  27.03 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.36 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  26.06 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  25.13 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  27.32 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  27.18 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.69 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  26.26 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  28.57 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  26.71 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.75 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  26.53 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  32.35 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.87 
 
 		 384 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  25.44 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  29.29 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  23.97 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.74 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  24.75 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  29.34 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 284 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  23.27 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  25.25 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 378 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 376 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0495  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.16 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 281 aa  52.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 		 368 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  23.98 
 
 		 382 aa  52.4  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  26.67 
 
 		 259 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  24.87 
 
 		 384 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 254 aa  52.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  23.76 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  27 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 		 271 aa  52  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>