88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0457 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  100 
 
 
267 aa  520  1e-147  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0870  ABC-2 type transporter  60.67 
 
 
267 aa  315  6e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.329831 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0764  ABC-2 type transporter  43.12 
 
 
269 aa  246  4e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  31.46 
 
 
308 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  35.21 
 
 
270 aa  135  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0666  ABC-2 type transporter  34.32 
 
 
270 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.521006  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1477  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1517  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  23.51 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1930  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 
286 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1602  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 
268 aa  62.8  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.863835  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  23.2 
 
 
365 aa  59.7  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 
372 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 
375 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  23.2 
 
 
365 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  26.36 
 
 
365 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  27.78 
 
 
372 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  25 
 
 
371 aa  53.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  23.67 
 
 
369 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  20 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  28.78 
 
 
368 aa  53.1  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 
290 aa  52.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 
375 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  21.05 
 
 
376 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1399  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 
372 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  23.77 
 
 
377 aa  50.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2879  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 
286 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1398  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 
278 aa  49.3  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.541771  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 
377 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  25.15 
 
 
376 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 
374 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  23 
 
 
380 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  29.51 
 
 
370 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 
376 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  26.81 
 
 
376 aa  46.2  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1478  ABC-2 type transporter  34.65 
 
 
253 aa  46.2  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1518  ABC-2 type transporter  34.65 
 
 
253 aa  46.2  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  22 
 
 
413 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1603  ABC-2 type transporter  34.94 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3976  ABC-2 type transporter  20 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2611  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  24.61 
 
 
376 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 
363 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  25.38 
 
 
381 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  24.83 
 
 
386 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  36.84 
 
 
278 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  22.09 
 
 
381 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  23.56 
 
 
376 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  25.34 
 
 
371 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  24.61 
 
 
391 aa  43.5  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2667  ABC-2 type transporter  22.82 
 
 
993 aa  43.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2723  ABC-2 type transporter  22.82 
 
 
993 aa  43.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  22.97 
 
 
257 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  25 
 
 
379 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1407  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 
390 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  22.97 
 
 
257 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  35.09 
 
 
278 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  35.09 
 
 
278 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  35.09 
 
 
278 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  29.77 
 
 
277 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  35.09 
 
 
278 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 
372 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  35.09 
 
 
278 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  35.09 
 
 
278 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  35.09 
 
 
278 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 
371 aa  42.4  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2610  ABC-2 type transporter  21.58 
 
 
273 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  24.64 
 
 
369 aa  42.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 
369 aa  42.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  24.61 
 
 
376 aa  42.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
260 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  25.56 
 
 
278 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 
255 aa  42.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  27.21 
 
 
279 aa  42  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 
376 aa  42  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>