148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0407 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 308 aa  595  1e-169  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  60.74 
 
 		 270 aa  326  3e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  60.74 
 
 		 270 aa  326  3e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  47.41 
 
 		 270 aa  242  5e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0666  ABC-2 type transporter  47.78 
 
 		 270 aa  238  8e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.521006  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  31.46 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0870  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.329831 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0764  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 279 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  25.43 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3976  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  21.84 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  22.99 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1478  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1518  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1398  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.541771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 269 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  22.41 
 
 		 369 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  23.79 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  21.97 
 
 		 369 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  25.28 
 
 		 386 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  23.5 
 
 		 372 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  24.51 
 
 		 377 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  21.39 
 
 		 413 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  20.83 
 
 		 370 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  23.29 
 
 		 368 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  23.29 
 
 		 368 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  23.29 
 
 		 368 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  23.29 
 
 		 368 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  23.29 
 
 		 368 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  27.81 
 
 		 372 aa  52.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  22.62 
 
 		 365 aa  52.8  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 374 aa  52.8  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  26.38 
 
 		 378 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  27.81 
 
 		 372 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  22.62 
 
 		 365 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1477  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  26.12 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1517  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 376 aa  50.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  36.76 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  20.11 
 
 		 370 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  25.35 
 
 		 368 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  23.29 
 
 		 368 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 		 368 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  23.29 
 
 		 368 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 		 368 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  23.29 
 
 		 368 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 		 368 aa  50.4  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  23.29 
 
 		 368 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  23.29 
 
 		 368 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  27.81 
 
 		 372 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 		 368 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  23.29 
 
 		 368 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  23.29 
 
 		 368 aa  50.4  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  23.58 
 
 		 365 aa  50.1  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  40 
 
 		 347 aa  50.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 		 443 aa  50.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  22.92 
 
 		 369 aa  49.7  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  22.92 
 
 		 369 aa  49.7  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  21.59 
 
 		 370 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0723  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.36 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.394403  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  23.56 
 
 		 391 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  25.16 
 
 		 353 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  28.86 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1399  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  24.26 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  23.87 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  23.6 
 
 		 936 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  23.6 
 
 		 936 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  27.47 
 
 		 380 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  22.86 
 
 		 435 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1136  hypothetical protein  26.13 
 
 		 381 aa  46.6  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  22.58 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 		 241 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  24.32 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  19.08 
 
 		 369 aa  46.6  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  22.01 
 
 		 379 aa  46.6  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  24.69 
 
 		 269 aa  46.2  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2611  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 271 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2625  ABC-2 type transporter  41.86 
 
 		 372 aa  46.2  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 368 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 		 398 aa  45.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2879  ABC-2 type transporter  23.04 
 
 		 286 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  21.43 
 
 		 373 aa  45.8  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>