55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1399 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1399  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 278 aa  548  1e-155  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1657  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0203159  decreased coverage  0.000243184 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  30.81 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  24.76 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1398  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.541771  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  24.76 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4337  hypothetical protein  28.11 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100167  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0525  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127264 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 273 aa  52.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  23.39 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 290 aa  49.7  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1603  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 245 aa  47.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  23.56 
 
 		 388 aa  46.6  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0230  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0145585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  25.25 
 
 		 282 aa  45.8  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3260  hypothetical protein  26.14 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.698821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3976  ABC-2 type transporter  26.71 
 
 		 289 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  28.95 
 
 		 244 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  25.68 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  28.95 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  27.83 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  27.63 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  27.63 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  27.63 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  27.63 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  32.73 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  27.63 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  27.63 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1517  ABC-2 type transporter  20.93 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  26.32 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1477  ABC-2 type transporter  20.93 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  27.64 
 
 		 376 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1136  hypothetical protein  24 
 
 		 381 aa  43.1  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1137  ABC-2 type transporter  28.25 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.18489  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  40.74 
 
 		 253 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  26.63 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  22.73 
 
 		 269 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 		 286 aa  42.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 267 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4696  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 384 aa  42.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 380 aa  42.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>