44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1137 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1137  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 260 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.18489  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1618  ABC-2 type transporter  40.91 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.794446 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1657  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0203159  decreased coverage  0.000243184 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  34.43 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  34.43 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0870  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.329831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  37.93 
 
 		 281 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  35.58 
 
 		 254 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  37.97 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1474  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.96 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  40.26 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1603  ABC-2 type transporter  34.62 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.96 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  44.44 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  38.64 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0764  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1478  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.7 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0902  ABC-2 type transporter  30.82 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1518  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1730  hypothetical protein  35.71 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.45161 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  45.65 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  38.03 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  41.07 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  37.66 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1958  ABC-2 type transporter  38.89 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00055396  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0666  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.521006  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  52.5 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  52.5 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  32.31 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  44.44 
 
 		 286 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  42.22 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  31.03 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 		 366 aa  42.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 		 308 aa  42.4  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  36.99 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  47.5 
 
 		 251 aa  42  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2611  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 		 271 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>