34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1474 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1474  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 256 aa  509  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1007  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 259 aa  92.8  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.200229  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.14 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.25 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1657  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0203159  decreased coverage  0.000243184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  25.3 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  22.96 
 
 		 284 aa  52.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4309  hypothetical protein  21.97 
 
 		 261 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.76 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.5 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.62 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  21.96 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.25 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  27.78 
 
 		 382 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  33.08 
 
 		 367 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  26.06 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1478  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 253 aa  45.8  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1518  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 253 aa  45.8  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  27.16 
 
 		 264 aa  45.4  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.58 
 
 		 365 aa  45.4  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.39 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  28.71 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 373 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 375 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1742  ABC-2 type transporter  25.65 
 
 		 401 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00338931 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  31.54 
 
 		 366 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  24.89 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  28.05 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 371 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  25.32 
 
 		 368 aa  42.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 375 aa  42  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 369 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>