15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1007 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1007  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.200229  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1474  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  25.18 
 
 		 286 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  23.02 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  29.55 
 
 		 915 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1478  ABC-2 type transporter  23.67 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1518  ABC-2 type transporter  23.67 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  28.98 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  29.58 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 375 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  28.41 
 
 		 241 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  26.78 
 
 		 916 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  25.57 
 
 		 932 aa  42.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  26.78 
 
 		 916 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>