124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0152 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 325 aa  622  1e-177  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  34.13 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  37.95 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0714  ABC-2 type transporter  30.07 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  23.31 
 
 		 360 aa  75.9  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  22.7 
 
 		 360 aa  75.9  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  22.7 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  23.51 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  23.26 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  30.83 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  24.84 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  22.91 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  23.72 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  22.91 
 
 		 353 aa  57  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  27.78 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  22.82 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  20.86 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  24.76 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  22.36 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 375 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  23.23 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  22.99 
 
 		 251 aa  53.1  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  22.78 
 
 		 344 aa  53.1  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 245 aa  52.8  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  23.81 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  18.6 
 
 		 380 aa  50.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 377 aa  50.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  25.32 
 
 		 371 aa  50.1  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  25 
 
 		 376 aa  49.7  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  23.5 
 
 		 379 aa  49.7  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 		 370 aa  49.3  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 270 aa  49.3  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 270 aa  49.3  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  19.87 
 
 		 366 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4308  hypothetical protein  21.25 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  24.06 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  28.21 
 
 		 243 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  20.36 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  23.71 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 		 257 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 262 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  25 
 
 		 376 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  23.88 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  26.49 
 
 		 943 aa  46.6  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  22.64 
 
 		 251 aa  46.6  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  25 
 
 		 259 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  21.74 
 
 		 267 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  25.14 
 
 		 361 aa  46.6  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2625  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 372 aa  46.6  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 		 370 aa  46.2  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  23.23 
 
 		 375 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  20.99 
 
 		 261 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  21.62 
 
 		 371 aa  46.2  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 		 281 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  24.66 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.55 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  21.47 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0589  ABC-2 type transporter  22.5 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  21.88 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  23.78 
 
 		 379 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  17.48 
 
 		 231 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  24.36 
 
 		 259 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  20.63 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0539  ABC-2 type transporter  21.38 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  23.33 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  20.73 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  19.9 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1637  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  23.33 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  22.92 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  23.33 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  21.92 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  23.33 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  23.33 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  21.71 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  23.33 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.19 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  23.33 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  23.02 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  22.34 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.74 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  19.86 
 
 		 286 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 		 270 aa  43.9  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 		 381 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  25.55 
 
 		 290 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  17.39 
 
 		 369 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  19.4 
 
 		 375 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>