41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0589 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0589  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 222 aa  446  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2825  ABC-2 type transporter  32.24 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0475  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1056  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.655499  normal  0.0850571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5082  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 302 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28460  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1430  hypothetical protein  25.15 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287279  normal  0.0390822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1630  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 		 276 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68052  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18060  ABC-2 type transporter  20 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  22.78 
 
 		 371 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  24.35 
 
 		 366 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  24.72 
 
 		 380 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  24.72 
 
 		 380 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  22.42 
 
 		 325 aa  46.2  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 388 aa  45.4  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  21.97 
 
 		 348 aa  45.4  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 		 372 aa  45.1  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 371 aa  45.1  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  21.08 
 
 		 901 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  20 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  22.51 
 
 		 279 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 		 372 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  19.41 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  26.35 
 
 		 259 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 		 413 aa  43.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  24.16 
 
 		 380 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  20.51 
 
 		 336 aa  43.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4696  ABC-2 type transporter  21.18 
 
 		 384 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  18.08 
 
 		 1106 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  38.6 
 
 		 258 aa  42.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  18.88 
 
 		 691 aa  42.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  38.6 
 
 		 258 aa  42.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  23.81 
 
 		 373 aa  42.4  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  22.97 
 
 		 368 aa  42  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  21.74 
 
 		 367 aa  42  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  17.39 
 
 		 279 aa  41.6  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 373 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 373 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 		 373 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>