36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1630 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1630  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 276 aa  522  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68052  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28460  ABC-2 type transporter  58.26 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30630  ABC-type multidrug transport system, permease component  48.71 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18060  ABC-2 type transporter  36.77 
 
 		 234 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0475  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0589  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  31.96 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 375 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2825  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.38 
 
 		 359 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0699  hypothetical protein  27.04 
 
 		 363 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2895  ABC-2 type transporter, permease protein  27.04 
 
 		 363 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0534  ABC-2 type transporter, permease protein  27.04 
 
 		 363 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359277  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0516  ABC-2 type transporter, permease protein  27.04 
 
 		 363 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948898  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1467  putative ABC transporter, permease protein  27.04 
 
 		 363 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0121  ABC-2 type transporter, permease protein  27.04 
 
 		 363 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3151  ABC transporter, permease protein, putative  27.04 
 
 		 363 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  27.87 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  34.29 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0505  ABC-2 type transporter  20.92 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000955112  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  24.4 
 
 		 339 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 373 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  25.46 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 		 377 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  25.13 
 
 		 366 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  19.9 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  22.56 
 
 		 379 aa  43.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  25.5 
 
 		 385 aa  42.7  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  22.73 
 
 		 380 aa  42.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>