61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30630 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_30630  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 273 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1630  ABC-2 type transporter  50.72 
 
 		 276 aa  179  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68052  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28460  ABC-2 type transporter  48.39 
 
 		 245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18060  ABC-2 type transporter  36.02 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0475  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 375 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.86 
 
 		 339 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  25.43 
 
 		 360 aa  53.1  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  28.71 
 
 		 245 aa  52.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  33.73 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  30.48 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  30.22 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 		 360 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  28.95 
 
 		 390 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0589  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 222 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  31.85 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 		 390 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  29.45 
 
 		 281 aa  48.9  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  25.29 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  29.71 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  28.31 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 		 368 aa  46.6  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 		 370 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  29.03 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 405 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  26.24 
 
 		 260 aa  46.2  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  28.24 
 
 		 232 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  29.07 
 
 		 371 aa  45.8  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  30.28 
 
 		 369 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  30.07 
 
 		 370 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  29.45 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 378 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 368 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1467  putative ABC transporter, permease protein  26.5 
 
 		 363 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3151  ABC transporter, permease protein, putative  26.5 
 
 		 363 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.99 
 
 		 359 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  28.29 
 
 		 390 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0121  ABC-2 type transporter, permease protein  26.5 
 
 		 363 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 368 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2895  ABC-2 type transporter, permease protein  26.5 
 
 		 363 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  25.82 
 
 		 368 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 383 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  29.59 
 
 		 358 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 383 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 272 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0534  ABC-2 type transporter, permease protein  26.5 
 
 		 363 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359277  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0516  ABC-2 type transporter, permease protein  26.5 
 
 		 363 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948898  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  29.68 
 
 		 385 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  22.29 
 
 		 336 aa  42.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0699  hypothetical protein  26.5 
 
 		 363 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2973  multidrug ABC transporter inner membrane protein  25.39 
 
 		 226 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206648 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 		 241 aa  42  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 		 272 aa  42  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  30.34 
 
 		 370 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2825  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 		 253 aa  42  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>