192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0121 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA3151  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 363 aa  712    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0699  hypothetical protein  99.72 
 
 		 363 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0121  ABC-2 type transporter, permease protein  100 
 
 		 363 aa  712    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1467  putative ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 363 aa  712    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0516  ABC-2 type transporter, permease protein  99.72 
 
 		 363 aa  709    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948898  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0534  ABC-2 type transporter, permease protein  99.45 
 
 		 363 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359277  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2895  ABC-2 type transporter, permease protein  100 
 
 		 363 aa  712    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  57.85 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  56.16 
 
 		 359 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  56.32 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  56.16 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  56.16 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  25.27 
 
 		 360 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  24.38 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.85 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  27.76 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  23.88 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  28.71 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  27 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  31.75 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  23.95 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0539  ABC-2 type transporter  22.05 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  21.74 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  23.28 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  30.2 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.58 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  23.7 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  26.06 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  24.23 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  28.86 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  28.57 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  18.97 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  26.6 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 281 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  27.44 
 
 		 383 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  34.82 
 
 		 250 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 383 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  24.3 
 
 		 341 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.34 
 
 		 384 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  24.37 
 
 		 370 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 378 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  25.41 
 
 		 373 aa  53.9  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  23.99 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1667  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 238 aa  53.5  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0141124  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 384 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 379 aa  53.1  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16770  ABC-2 type transporter, permease component  23.74 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00841824  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 		 384 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 266 aa  53.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  26.52 
 
 		 339 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  30.57 
 
 		 244 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  28.12 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  26.26 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  26.78 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3479  ABC transporter protein  27.91 
 
 		 254 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  24.41 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 278 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  24.88 
 
 		 276 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1407  ABC-2 type transporter  25.99 
 
 		 390 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 290 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  21.83 
 
 		 363 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  26.59 
 
 		 1106 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  26.78 
 
 		 339 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  20.16 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 257 aa  50.4  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 		 231 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  24.31 
 
 		 339 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.58 
 
 		 285 aa  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 		 279 aa  49.7  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  24.31 
 
 		 339 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  28 
 
 		 339 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0557  hypothetical protein  24.81 
 
 		 379 aa  49.7  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 366 aa  49.7  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  28 
 
 		 339 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  28 
 
 		 339 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.07 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 280 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  23.18 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  23.75 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  24.44 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  24.44 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1630  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>