95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0539 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0539  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 361 aa  721    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  99.17 
 
 		 361 aa  717    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0150  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0712  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 374 aa  153  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0277  ABC-2 type transporter  28.53 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 375 aa  93.2  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  27.91 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  27.3 
 
 		 360 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  27.39 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  21.17 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  23.81 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.09 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  21.79 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.12 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0699  hypothetical protein  22.27 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0516  ABC-2 type transporter, permease protein  22.27 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948898  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0534  ABC-2 type transporter, permease protein  22.27 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359277  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0121  ABC-2 type transporter, permease protein  22.27 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1467  putative ABC transporter, permease protein  22.27 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3151  ABC transporter, permease protein, putative  22.27 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2895  ABC-2 type transporter, permease protein  22.27 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  23.84 
 
 		 341 aa  53.9  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  21.56 
 
 		 358 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  21.05 
 
 		 359 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 368 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  25.62 
 
 		 368 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  21.05 
 
 		 359 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  21.05 
 
 		 359 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0714  ABC-2 type transporter  22.78 
 
 		 332 aa  52.8  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  21.74 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  30.91 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  23.16 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  22.25 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  23.06 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 		 368 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1407  ABC-2 type transporter  21.52 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  22.31 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  21.98 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  20.97 
 
 		 257 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  24.75 
 
 		 370 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  23.61 
 
 		 254 aa  46.6  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  28.24 
 
 		 251 aa  46.6  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  18.97 
 
 		 373 aa  46.2  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  19.71 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  21.86 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  24.01 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  22.16 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  22.16 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  22.26 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  22.16 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  22.39 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  21.22 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4686  ABC-2 type transporter  23.15 
 
 		 253 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.731572  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  22.16 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.658285 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  22.5 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  22.16 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  22.16 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  26.63 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.62 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  24.85 
 
 		 1106 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  25.39 
 
 		 261 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  22.26 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0861  ABC-2 type transporter  21.71 
 
 		 255 aa  43.9  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0630993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 231 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  22.26 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  22.26 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  22.26 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  23.88 
 
 		 261 aa  43.9  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6150  putative ABC-2 type transporter (permease protein)  23.6 
 
 		 253 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00809538  normal  0.0938496 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  22.09 
 
 		 369 aa  43.5  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 		 391 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0567  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 253 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2924  putative ABC transporter inner membrane subunit  23.44 
 
 		 253 aa  43.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 391 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  23.17 
 
 		 367 aa  43.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  25.45 
 
 		 251 aa  42.7  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  20.81 
 
 		 365 aa  42.7  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0091  ABC transporter  27.15 
 
 		 253 aa  42.7  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>