172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0277 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0277  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 380 aa  754    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0539  ABC-2 type transporter  28.53 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0712  ABC-2 type transporter  28.03 
 
 		 374 aa  112  8.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0150  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  26.26 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  24.35 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.56 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  23.88 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  27.33 
 
 		 251 aa  67  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  22.43 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  22.56 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  25.79 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  23.51 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  26.3 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4696  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.3 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  24.21 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  21.81 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  24.28 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  24.28 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  24.28 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  24.28 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  24.28 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0714  ABC-2 type transporter  34.57 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  29.08 
 
 		 382 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  24.91 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  22.75 
 
 		 327 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  29.56 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  24.1 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  19.7 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  22.87 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  21.35 
 
 		 375 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  25 
 
 		 284 aa  57  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 281 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  22.22 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.658285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  26.46 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  22.1 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  22.1 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  22.1 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  22.1 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  22.1 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  22.1 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  22.1 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  22.1 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 		 253 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  26.26 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  23 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  25.97 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  23 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  22.67 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  26.06 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  21.74 
 
 		 261 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  26.71 
 
 		 377 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  22.86 
 
 		 268 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 256 aa  54.3  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 		 368 aa  53.5  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 325 aa  53.1  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  25.29 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  25.43 
 
 		 280 aa  53.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  22.43 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  25.29 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0613  ABC-2 type transporter  20 
 
 		 247 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  22.33 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  23.2 
 
 		 266 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31 
 
 		 255 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 		 380 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  24.86 
 
 		 277 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  23.16 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  25.16 
 
 		 285 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  24.21 
 
 		 264 aa  50.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  25.7 
 
 		 368 aa  50.1  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  28.47 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  28.06 
 
 		 385 aa  50.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  21.85 
 
 		 372 aa  50.1  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  25.47 
 
 		 377 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  23.58 
 
 		 364 aa  49.7  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  23.29 
 
 		 370 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8102  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 379 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  23.62 
 
 		 274 aa  49.7  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 367 aa  49.7  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  28.47 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>