284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0825 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  100 
 
 		 261 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  44.08 
 
 		 246 aa  175  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  38.84 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  41.56 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  40.66 
 
 		 231 aa  158  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  36.99 
 
 		 262 aa  138  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  36.1 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0613  ABC-2 type transporter  41.06 
 
 		 247 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  33.94 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  36.59 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3801  ABC-2 type transporter  35.68 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  32.18 
 
 		 247 aa  95.1  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  29.24 
 
 		 339 aa  92.8  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 		 360 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  28.65 
 
 		 360 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  33.75 
 
 		 443 aa  89.7  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  26.86 
 
 		 247 aa  89  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  27.31 
 
 		 327 aa  87.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  26.1 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4920  ABC-2 type transporter  36.25 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 		 366 aa  75.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 		 413 aa  75.5  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  25.7 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  24.74 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  21.96 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  25.9 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 344 aa  65.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  25.65 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  22.93 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.86 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1227  ABC-2 type transporter  28.25 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.49 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  22.28 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  32.32 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  29.23 
 
 		 375 aa  58.9  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  22.73 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  22.73 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  22.14 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.69 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  24.17 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  21.74 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  22.84 
 
 		 427 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  24.02 
 
 		 341 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  32.81 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  28.66 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  22.35 
 
 		 365 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0277  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 380 aa  53.5  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  29.45 
 
 		 380 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  27.59 
 
 		 381 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 356 aa  53.5  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  25.38 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  24.34 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0926  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  25.65 
 
 		 353 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 378 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 384 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 372 aa  52  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  23.05 
 
 		 280 aa  52  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  27.15 
 
 		 377 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  29.45 
 
 		 369 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  26.63 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 		 368 aa  51.6  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.24 
 
 		 356 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.95 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 388 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 		 384 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 		 375 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.53 
 
 		 380 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 384 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  28.46 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  23.58 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  25.95 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1716  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 366 aa  49.7  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  23.58 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 		 414 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>