69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4920 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4920  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 249 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  46.15 
 
 		 244 aa  158  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  44 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  39.68 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  38.15 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0613  ABC-2 type transporter  40.48 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  38.87 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  36.25 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  38.89 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  35.55 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  33.86 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3801  ABC-2 type transporter  35.54 
 
 		 267 aa  99.8  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  29.08 
 
 		 276 aa  62  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3479  ABC transporter protein  30.98 
 
 		 254 aa  62  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  24.72 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  25.28 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0926  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  24.72 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0290  putative integral membrane protein  30.96 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528279  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  31.73 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  34.27 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  24.02 
 
 		 327 aa  52  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  20.77 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2470  ABC-2 type transporter  33.03 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.218035  hitchhiker  0.00397591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  24.28 
 
 		 257 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 375 aa  48.9  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 413 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  28.93 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  22.95 
 
 		 325 aa  47  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.7 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  25.71 
 
 		 341 aa  45.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  28.11 
 
 		 255 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 244 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  27.87 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 		 413 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0506  ABC-2 type transporter  30.69 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  27.87 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  27.87 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  32.75 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  27.87 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  27.87 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  29.15 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.96 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 265 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 356 aa  42.4  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  27.05 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  25.14 
 
 		 358 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0277  ABC-2 type transporter  19.11 
 
 		 380 aa  42.4  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  27.05 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 244 aa  42  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 252 aa  42  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>