63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3801 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3801  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 267 aa  501  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  40.1 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  41.45 
 
 		 231 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  35.54 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  32.24 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 		 278 aa  112  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  32.23 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0613  ABC-2 type transporter  32.49 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  33.97 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  42.94 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 		 267 aa  85.5  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  32.96 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4920  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  30.32 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  32.22 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  33.88 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  26.86 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0290  putative integral membrane protein  31.61 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528279  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0926  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  25.3 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  29.53 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11540  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.608741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 360 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  28.79 
 
 		 339 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  28.79 
 
 		 360 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  29.87 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 		 266 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  27.03 
 
 		 261 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0506  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 251 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  33.05 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 		 366 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  30.7 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  26.51 
 
 		 276 aa  48.9  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  31.97 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  20.69 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  20.69 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  20.1 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  22.15 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  25.6 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 285 aa  45.4  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  26.53 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  24.33 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  21.16 
 
 		 336 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  29.34 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  26.57 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1076  ABC transporter membrane protein  29.63 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0598525  normal  0.0512291 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  28.12 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_124  ABC transporter, type 2, permease protein  30.91 
 
 		 352 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 344 aa  42  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>