271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1354 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 257 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  68.25 
 
 		 266 aa  301  8.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  68.7 
 
 		 304 aa  299  4e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  60.57 
 
 		 257 aa  250  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  64.2 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  52.63 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  52.99 
 
 		 261 aa  205  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  53.17 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  49.8 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  54.76 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  51.87 
 
 		 269 aa  188  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  51.35 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  51.21 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  46.4 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  49.8 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  50 
 
 		 269 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  51.41 
 
 		 263 aa  175  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  54.93 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  50.23 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  49.4 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  56.85 
 
 		 258 aa  152  7e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  58.94 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  46.41 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  42.8 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  47.6 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  47.18 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  44.68 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  43.78 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  44.18 
 
 		 258 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  44.18 
 
 		 258 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  44.18 
 
 		 258 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  44.18 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  39.58 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  26.6 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  29.18 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  26.6 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  32.65 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 360 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  32.13 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  27.9 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  27.53 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  26.09 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  28.04 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.49 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  30.72 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  26.43 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  32.82 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  31.36 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  32.26 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.93 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1189  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000916915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  33.98 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 		 366 aa  58.9  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  30.23 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3479  ABC transporter protein  30.61 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.21 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  28.03 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.76 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  28.57 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  26.89 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  31.15 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3801  ABC-2 type transporter  34.22 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  30.35 
 
 		 359 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  28.03 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  28.03 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  28.03 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.85 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  27.2 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  30.27 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  31.12 
 
 		 358 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  30.35 
 
 		 359 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  30.35 
 
 		 359 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  28.86 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 363 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  29.85 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  27.73 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  24.17 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>