95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1408 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  100 
 
 
243 aa  488  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  100 
 
 
243 aa  488  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  53.3 
 
 
243 aa  266  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  34.83 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  34.18 
 
 
244 aa  134  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  31.65 
 
 
244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  31.65 
 
 
244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  31.65 
 
 
244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 
244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 
244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  31.65 
 
 
244 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  31.65 
 
 
244 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  30.38 
 
 
244 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  30.38 
 
 
244 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1292  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.78 
 
 
245 aa  122  5e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000120577  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  28.51 
 
 
241 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 
246 aa  87  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  23.66 
 
 
271 aa  72  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 
269 aa  62.4  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  22.06 
 
 
281 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  20.4 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  24.9 
 
 
280 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  21.46 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 
285 aa  55.8  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01010  ABC-type multidrug transport system, permease component  26 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 
306 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1939  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  23.39 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1905  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 
255 aa  52.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  29.85 
 
 
413 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 
250 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  24 
 
 
251 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  25.47 
 
 
261 aa  52  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0256  ABC-2 type transporter  22 
 
 
258 aa  52  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  19.67 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  20.2 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  28.06 
 
 
381 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  22.96 
 
 
244 aa  49.7  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  23.08 
 
 
244 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02220  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 
245 aa  48.9  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  21.76 
 
 
304 aa  48.9  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1451  hypothetical protein  23.56 
 
 
258 aa  48.5  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.245884  normal  0.0167299 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  28.78 
 
 
381 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 
381 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  26.43 
 
 
381 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  22.59 
 
 
443 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  25.95 
 
 
368 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  26.62 
 
 
381 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 
368 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 
256 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  23.65 
 
 
266 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  27.48 
 
 
381 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 
261 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  32.65 
 
 
380 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  21.11 
 
 
256 aa  45.8  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  24.82 
 
 
256 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 
287 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 
258 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 
366 aa  45.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 
366 aa  45.4  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  22.13 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  21.18 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  20.4 
 
 
369 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  25 
 
 
363 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 
368 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  20.68 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  22.61 
 
 
279 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  25.95 
 
 
381 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  19.67 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  23.5 
 
 
377 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  21.11 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  23.41 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4668  ABC-type multidrug transport system, permease component  34.62 
 
 
146 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 
269 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 
270 aa  43.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 
233 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  31.21 
 
 
398 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 
270 aa  43.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0654  ABC-2 type transporter  23.61 
 
 
270 aa  42.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 
366 aa  42.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 
418 aa  42  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3121  multidrug ABC transporter inner membrane protein  21.03 
 
 
274 aa  42  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 
253 aa  42  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>