119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2959 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 279 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1678  hypothetical protein  46.15 
 
 		 265 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1586  ABC-2 type transporter  41.58 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5478  ABC-2 type transporter  33.83 
 
 		 287 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03840  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.95 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4838  ABC-2 type transporter  35.16 
 
 		 266 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120323  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0290  putative integral membrane protein  31.32 
 
 		 285 aa  78.6  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528279  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3532  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5631  ABC-2 type transporter  32.18 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118129  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11540  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.608741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  26.06 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1076  ABC transporter membrane protein  30.48 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0598525  normal  0.0512291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.41 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1894  ABC transporter membrane protein  29.53 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0506  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  29.43 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  26.07 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  25.67 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6813  hypothetical protein  36.61 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  26.52 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  30.1 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  29.17 
 
 		 370 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  30.94 
 
 		 277 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  30.94 
 
 		 277 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  29.38 
 
 		 275 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  30.85 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  30.85 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  30.85 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  30.85 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  30.85 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  30.85 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  30.85 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1716  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 366 aa  52.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  29.44 
 
 		 285 aa  52.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  30.65 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1643  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 366 aa  51.6  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  29.31 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  30.73 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  27.1 
 
 		 360 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  30.73 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  29.89 
 
 		 278 aa  49.7  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.82 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  26.07 
 
 		 339 aa  49.3  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 		 377 aa  48.9  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  28.81 
 
 		 277 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 252 aa  48.9  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4677  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 367 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.521717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  27.37 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  28.98 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  28.2 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 		 378 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  28.25 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  28.25 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  26.43 
 
 		 378 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 366 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 		 368 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  27.78 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 		 377 aa  46.6  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 		 250 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 		 370 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  27.72 
 
 		 371 aa  46.2  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.15 
 
 		 365 aa  45.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  25.44 
 
 		 368 aa  46.2  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  25.7 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  26.96 
 
 		 368 aa  45.8  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 		 304 aa  45.4  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  29.19 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 370 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  25.71 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 377 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 366 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  32.33 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  31.39 
 
 		 385 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  27.38 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  28 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  26.26 
 
 		 443 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  28.94 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 366 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  22.64 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 367 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  25.39 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  24.55 
 
 		 378 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  28.26 
 
 		 373 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  32.26 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  23.17 
 
 		 375 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  24.4 
 
 		 376 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  29.45 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 		 376 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  31.28 
 
 		 375 aa  42.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 371 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>