46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4838 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4838  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 266 aa  491  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120323  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03840  ABC-type multidrug transport system, permease component  44.4 
 
 		 282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1586  ABC-2 type transporter  45.19 
 
 		 279 aa  175  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  38.12 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1678  hypothetical protein  38.55 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0506  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3532  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1076  ABC transporter membrane protein  34.36 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0598525  normal  0.0512291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1894  ABC transporter membrane protein  32.67 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5478  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0290  putative integral membrane protein  31.95 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528279  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5631  ABC-2 type transporter  32.3 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118129  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11540  ABC-2 type transporter  32.33 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.608741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  30.88 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  29.93 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  33.65 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  26.42 
 
 		 360 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  26.42 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  28.04 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.69 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  27.69 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  27.69 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 285 aa  45.8  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6993  ABC-2 type transporter  24.65 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6813  hypothetical protein  53.7 
 
 		 334 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  26.91 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  26.13 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3952  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0583359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 		 375 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 358 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  28.96 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  29.37 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  31.53 
 
 		 251 aa  42  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>