26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1678 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1678  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  44.9 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1586  ABC-2 type transporter  41 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5478  ABC-2 type transporter  39.25 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03840  ABC-type multidrug transport system, permease component  34.51 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4838  ABC-2 type transporter  38.55 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120323  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0290  putative integral membrane protein  31.18 
 
 		 285 aa  85.9  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528279  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3532  ABC-2 type transporter  33.71 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  30.42 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11540  ABC-2 type transporter  31.27 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.608741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0506  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5631  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118129  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  29.62 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.09 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 280 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1894  ABC transporter membrane protein  29.62 
 
 		 234 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 306 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1076  ABC transporter membrane protein  25.95 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0598525  normal  0.0512291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6813  hypothetical protein  37.29 
 
 		 334 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 336 aa  43.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0091  ABC transporter  31.71 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>