15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1076 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1076  ABC transporter membrane protein  100 
 
 		 242 aa  467  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0598525  normal  0.0512291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1894  ABC transporter membrane protein  44.31 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11540  ABC-2 type transporter  32.65 
 
 		 249 aa  95.5  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.608741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0506  ABC-2 type transporter  34.02 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5631  ABC-2 type transporter  31.54 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118129  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03840  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.64 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  32.41 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1586  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 279 aa  68.6  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4838  ABC-2 type transporter  34.36 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3532  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 		 277 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5478  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1678  hypothetical protein  25.95 
 
 		 265 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  28.89 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  33.33 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 		 304 aa  42  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>