21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03840 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03840  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 282 aa  536  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1586  ABC-2 type transporter  40.51 
 
 		 279 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4838  ABC-2 type transporter  44.4 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1678  hypothetical protein  34.51 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  34.15 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3532  ABC-2 type transporter  36.68 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1076  ABC transporter membrane protein  32.03 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0598525  normal  0.0512291 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5478  ABC-2 type transporter  29.59 
 
 		 287 aa  72  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1894  ABC transporter membrane protein  30.71 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11540  ABC-2 type transporter  31.42 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.608741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0506  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5631  ABC-2 type transporter  31.64 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118129  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  26.3 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0290  putative integral membrane protein  28.9 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528279  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  26.62 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  26.46 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 		 366 aa  45.8  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  24.51 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 262 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>