113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0173 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  100 
 
 
262 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  40.08 
 
 
251 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  36.48 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  38.84 
 
 
261 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  36.67 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  36.55 
 
 
231 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  32.24 
 
 
232 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0613  ABC-2 type transporter  35.86 
 
 
247 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  34.4 
 
 
278 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  34.1 
 
 
267 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4920  ABC-2 type transporter  39.11 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13049  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3801  ABC-2 type transporter  33.97 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  29.77 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  28.71 
 
 
366 aa  72.4  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 
247 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 
358 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  32.56 
 
 
336 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 
278 aa  63.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 
306 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  33.17 
 
 
261 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 
443 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 
281 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  25.89 
 
 
280 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.25 
 
 
339 aa  58.9  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  27 
 
 
265 aa  58.9  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 
280 aa  58.9  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.11 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  24.75 
 
 
360 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 
360 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 
304 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0531  ABC transporter permease  24.59 
 
 
241 aa  55.8  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  26.41 
 
 
244 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  26.41 
 
 
244 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  24.44 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  25.97 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  25.97 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  25.97 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  25.97 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  24.51 
 
 
413 aa  53.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 
241 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  26.1 
 
 
280 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 
375 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  26.63 
 
 
244 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  28.42 
 
 
244 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 
251 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0926  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 
236 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 
269 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  24.59 
 
 
251 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 
245 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 
252 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 
244 aa  49.3  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 
261 aa  49.3  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 
358 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 
370 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  30.99 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  22.57 
 
 
327 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  26.83 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  30.61 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  22.44 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  26.07 
 
 
250 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  26.28 
 
 
356 aa  46.6  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.32 
 
 
284 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 
247 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  20.42 
 
 
243 aa  45.8  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  28.74 
 
 
273 aa  45.8  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  23.27 
 
 
279 aa  45.4  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4327  ABC-2 type transporter  34.31 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1056  ABC-2 type transporter  32.41 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.655499  normal  0.0850571 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 
369 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 
298 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 
344 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2470  ABC-2 type transporter  32.73 
 
 
247 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.218035  hitchhiker  0.00397591 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 
437 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  26.86 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  21.8 
 
 
367 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 
380 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0701  hypothetical protein  26.55 
 
 
242 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.320058  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  24.52 
 
 
287 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2873  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  24.52 
 
 
287 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2858  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  24.52 
 
 
287 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  28.27 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.16 
 
 
359 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 
348 aa  43.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 
359 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 
279 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2004  ABC-2 type transporter  18.52 
 
 
257 aa  43.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  0.589984 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>