11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1894 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1894  ABC transporter membrane protein  100 
 
 		 234 aa  457  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1076  ABC transporter membrane protein  44.31 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0598525  normal  0.0512291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11540  ABC-2 type transporter  39.43 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.608741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0506  ABC-2 type transporter  33.76 
 
 		 251 aa  101  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5631  ABC-2 type transporter  38.14 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118129  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03840  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.31 
 
 		 282 aa  85.5  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4838  ABC-2 type transporter  31.87 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120323  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  30.42 
 
 		 279 aa  81.6  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1586  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1678  hypothetical protein  31.03 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5478  ABC-2 type transporter  24.23 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>