14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11540 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11540  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 249 aa  485  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.608741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1894  ABC transporter membrane protein  39.59 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0506  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1076  ABC transporter membrane protein  33.47 
 
 		 242 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0598525  normal  0.0512291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5631  ABC-2 type transporter  34 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118129  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1586  ABC-2 type transporter  34.72 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  34.57 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03840  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.77 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1678  hypothetical protein  32.17 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5478  ABC-2 type transporter  29.12 
 
 		 287 aa  72  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4838  ABC-2 type transporter  31.95 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120323  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3801  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 267 aa  52  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0290  putative integral membrane protein  31.63 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528279  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3532  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>