23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5631 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5631  ABC-2 type transporter  100 
 
 
250 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118129  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0506  ABC-2 type transporter  41.3 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1894  ABC transporter membrane protein  38.14 
 
 
234 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11540  ABC-2 type transporter  34.8 
 
 
249 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.608741  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1076  ABC transporter membrane protein  31.54 
 
 
242 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0598525  normal  0.0512291 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03840  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.64 
 
 
282 aa  85.9  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5478  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1586  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1678  hypothetical protein  34.48 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4838  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120323  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3532  ABC-2 type transporter  32.16 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 
265 aa  49.3  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  32.95 
 
 
257 aa  48.9  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  27.68 
 
 
261 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  27.76 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 
278 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  30.29 
 
 
255 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 
267 aa  42.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0290  putative integral membrane protein  27.65 
 
 
285 aa  42  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>