114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2544 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 265 aa  500  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  53.52 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  50.2 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  55.51 
 
 		 261 aa  205  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  54.15 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  49.23 
 
 		 304 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  50.76 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  53.49 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  47.35 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  51.91 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  49.01 
 
 		 269 aa  171  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  47.79 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  52.19 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  45.9 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  45.74 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  46.59 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  44.83 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  48.05 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  44.21 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  44.79 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  44.53 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  47.62 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  49.59 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  43.95 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  41.89 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  47.13 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  40.08 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  48.69 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  42.21 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  41.83 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  41.83 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  42.29 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  32.54 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  30.21 
 
 		 360 aa  79  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  29.47 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  29.69 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.4 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 375 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  29.56 
 
 		 281 aa  67  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  24.63 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  25.48 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 367 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0967  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  27 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  32.38 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2004  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  23.91 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.35 
 
 		 356 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  22.91 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  22.91 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  22.03 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  22.47 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  22.47 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  24.1 
 
 		 244 aa  49.3  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  24.1 
 
 		 244 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  24.53 
 
 		 280 aa  49.3  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  25.18 
 
 		 280 aa  48.9  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  24.85 
 
 		 244 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.52 
 
 		 359 aa  48.9  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  28.35 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  28.78 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  28.78 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  24.1 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  30.82 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 359 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  24.34 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  26.94 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 		 290 aa  46.2  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  27.46 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 256 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0505  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 238 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000955112  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0150  ABC-2 type transporter  21.18 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  29.07 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  30.39 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  29.07 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  26.2 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  26.63 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  26.32 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  30.2 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  26.15 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 279 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  25.13 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  26.05 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  25.68 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  25.52 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>