More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0505 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0505  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000955112  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0991  ABC-2 type transporter  43.46 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1667  ABC-2 type transporter  39.15 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0141124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 366 aa  72  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  24.07 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  27.85 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 257 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 358 aa  65.1  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03055  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  25.46 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  21.4 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  24.07 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  26.54 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  27.72 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2924  putative ABC transporter inner membrane subunit  23.94 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  29.95 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2408  ABC-2 type transporter  26.86 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  22.67 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03360  ABC-2 type transport system permease component  26.29 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  29.27 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3083  ABC transporter permease  25.54 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.646009  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0749  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.41583 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0704  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5529  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3284  hypothetical protein  26.67 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0995545  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  27.39 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0861  ABC-2 type transporter  23.64 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0630993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0478  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704988  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 		 344 aa  55.1  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2362  ABC transporter, inner membrane subunit  24.85 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0916375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  24.48 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  26.44 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2524  ABC-2 type transporter  23.64 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 		 367 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3138  ABC-2 type transporter  26.86 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00549881  normal  0.763555 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1453  ABC-2 type transporter  24.72 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1221  ABC-2 type transporter  23.64 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.389129  decreased coverage  0.00710452 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4006  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  24.39 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  25.41 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3273  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, inner membrane subunit  26.32 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  27.74 
 
 		 373 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3534  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2741  hypothetical protein  24.85 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1161  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 		 274 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3270  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1714  ABC-2 type transporter  25.9 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1497  hypothetical protein  25.62 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1607  ABC-2 type transporter  21.82 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0979931  normal  0.144248 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.77 
 
 		 264 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  24.72 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1912  ABC-2 type transporter  22.11 
 
 		 253 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846791  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.09 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5044  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2018  hypothetical protein  24.85 
 
 		 253 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.803499  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4521  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2649  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4455  ABC-2 type transporter  29.88 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0350682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6150  putative ABC-2 type transporter (permease protein)  24.24 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00809538  normal  0.0938496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  26.98 
 
 		 370 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 		 368 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4411  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  25.9 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0540  ABC transporter, inner membrane subunit  25 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 327 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1926  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.14437 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0977  ABC transporter permease protein  24.24 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.024266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0967  ABC-2 type transporter  25.14 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 370 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  25.79 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  23.08 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  25.14 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  24.84 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  23.02 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3371  hypothetical protein  23.03 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>