242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21990 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 266 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  61.28 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  62.9 
 
 		 304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  62.6 
 
 		 262 aa  253  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  69.29 
 
 		 257 aa  251  6e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  50.21 
 
 		 252 aa  219  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  47.79 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  45.56 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  48.64 
 
 		 261 aa  188  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  49.39 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  44.53 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  49.34 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  41.95 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  48.44 
 
 		 279 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  42.98 
 
 		 275 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  45.17 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  47.1 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  44.23 
 
 		 269 aa  165  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  45.12 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  41.63 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  51.27 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  51.05 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  40.22 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  40.25 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  37.04 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  42.52 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  40.84 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  41.44 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  38.4 
 
 		 261 aa  123  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  39.02 
 
 		 258 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  41.05 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  41.05 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  36.93 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.91 
 
 		 339 aa  72  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  26.02 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  27.85 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  31.25 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  30.9 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  26.57 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  24.27 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  30 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  23.95 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.89 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  24.67 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  23.53 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  26.51 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  25.48 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  25 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  25.48 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  28.74 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  24.04 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  25.48 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  24.51 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.69 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  24.51 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.57 
 
 		 359 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  23.62 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  24.02 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  24.02 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  24.52 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3479  ABC transporter protein  30.21 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  29.95 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  23.62 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  23.62 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  23.62 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 252 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 359 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 359 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0091  ABC transporter  27.36 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  22.61 
 
 		 356 aa  52.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 270 aa  52.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 252 aa  52.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  25.29 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  28.89 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  29.22 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>