171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1137 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 257 aa  479  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  61.28 
 
 		 266 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  56.4 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  54.58 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  60.42 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  46.77 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  44.44 
 
 		 264 aa  169  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  45.95 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  45.83 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  45 
 
 		 261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  43.35 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  44.66 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  48.33 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  43.2 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  43.91 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  43.25 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  40.18 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  42.69 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  38.75 
 
 		 241 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  42.19 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  39.83 
 
 		 261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  49.79 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  37.11 
 
 		 275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  49.12 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  38.5 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  41.57 
 
 		 259 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  41.27 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  41.67 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  38.13 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  40.38 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  40 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  40 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  37.92 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  28.17 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  32.33 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  23.62 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  24.14 
 
 		 339 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 360 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 363 aa  55.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 		 367 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  26 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  24.26 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  24.26 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  23.27 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3736  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 		 289 aa  53.1  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  23.76 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  23.76 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  23.27 
 
 		 244 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.1 
 
 		 359 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  23.76 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  25.53 
 
 		 366 aa  52.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  30.43 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  23.27 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  23.27 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  31.12 
 
 		 359 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 		 279 aa  52  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.96 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.26 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.6 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  26.98 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  24.4 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  35.97 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  25.39 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  30.46 
 
 		 359 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  30.46 
 
 		 359 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  28 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  28.65 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  26.22 
 
 		 284 aa  49.3  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  28.86 
 
 		 246 aa  49.3  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  28.29 
 
 		 278 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 265 aa  49.3  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 288 aa  48.9  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0150  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 		 338 aa  49.3  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 358 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  30.1 
 
 		 358 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>