174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1842 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  100 
 
 
269 aa  510  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  83.2 
 
 
252 aa  392  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  51.82 
 
 
304 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  55.79 
 
 
262 aa  202  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  49.2 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  49.39 
 
 
266 aa  199  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  46.59 
 
 
265 aa  188  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  59.24 
 
 
258 aa  188  8e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  49.79 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  44.49 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  45.83 
 
 
257 aa  182  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  48.99 
 
 
261 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  45.34 
 
 
261 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  50.46 
 
 
255 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  52.7 
 
 
257 aa  169  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  42.15 
 
 
241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  43.59 
 
 
261 aa  162  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  42.4 
 
 
274 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  42.18 
 
 
275 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  47.18 
 
 
263 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  44.31 
 
 
269 aa  158  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  43.59 
 
 
279 aa  158  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  42.68 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  44.7 
 
 
268 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  41.8 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  43.27 
 
 
259 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  45.19 
 
 
257 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  41.88 
 
 
261 aa  142  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  52.5 
 
 
263 aa  135  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  40.41 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  41.22 
 
 
258 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  41.22 
 
 
258 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  37.04 
 
 
244 aa  85.5  8e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  29.46 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  27.78 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  28.5 
 
 
356 aa  72  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  26.78 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  26.56 
 
 
360 aa  68.9  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  26.56 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  29.22 
 
 
276 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 
257 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 
366 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  25 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  27.99 
 
 
272 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  28.77 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  26.46 
 
 
272 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  21.63 
 
 
244 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 
257 aa  56.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  29.26 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  21.15 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  29.8 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 
231 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 
367 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 
286 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 
261 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  22.12 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  21.63 
 
 
244 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  21.15 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  20.67 
 
 
244 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  20.67 
 
 
244 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  24.86 
 
 
261 aa  52.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  21.15 
 
 
244 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 
244 aa  52.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  24.75 
 
 
281 aa  52  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 
247 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  28.86 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.56 
 
 
359 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  31.61 
 
 
377 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 
251 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  26.32 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  20.19 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  20.19 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  28.14 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  27.32 
 
 
286 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  34.12 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 
375 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  20.19 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 
363 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 
292 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 
271 aa  49.7  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 
243 aa  49.7  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  29.41 
 
 
327 aa  49.3  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 
251 aa  48.9  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 
253 aa  48.9  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  28.12 
 
 
278 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 
233 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 
413 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  22.34 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  22.34 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.03 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0900218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>