50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2549 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4202  hypothetical protein  54.32 
 
 		 245 aa  235  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  40.5 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36170  ABC-type multidrug transport system, permease component  42.28 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3448  ABC-2 type transporter  44.21 
 
 		 271 aa  164  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0600663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  34.84 
 
 		 244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  34.01 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 265 aa  92  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  26.86 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  29.89 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  28.99 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  25.65 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  24.61 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  25.91 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  24.61 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  24.61 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  24.61 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  25.13 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  24.61 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  32.45 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02220  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  21.93 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2296  hypothetical protein  38.67 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 269 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 		 304 aa  52.4  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 443 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  20.09 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  20.09 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  30.92 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  25.31 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1939  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4668  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.67 
 
 		 146 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0256  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  27.37 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  25.9 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.22 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  25.13 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0344  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.261927  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  22.5 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>