34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0344 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0344  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 261 aa  497  1e-140  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.261927  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  31.74 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  26.99 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  29.15 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  27.47 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  28.02 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  28.02 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  27.47 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  27.47 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  27.47 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16230  ABC-2 type transporter  29.34 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.362441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  26.92 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  27.47 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  26.92 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  31.37 
 
 		 278 aa  49.3  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1939  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 242 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  32.11 
 
 		 241 aa  48.9  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  24.51 
 
 		 280 aa  45.4  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  30.48 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  33.33 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01010  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.82 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  31.43 
 
 		 246 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 275 aa  42  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>